Можно ли запретить на определенную внутреннюю линию установку ожидающих сообщений.

похоже нельзя, как ни странно DATA LINE SECURITY не помогает.

это запрещает подачу сигнала о наличи вызова в очереди (camp-on) когда по данной линии разговаривают (пп 2,4,5), при этом можно оставлять ожидать сообщения об ожидании (Message Wait).

Тогда другой вопрос как избавиться от прерывистого гудка при подъеме трубки?
Вроде по иструкции нужно подкуртить отвечающий за это таймер на 0.
Просмотрел таймеры вроде должен быть MSG Wait Reminder Tone Timer (31 в PC Admin)
но он установлен в 0, но в трубке всеравное сть оповещение.

Тут похоже установлена какая-либо переадресация или режим "Не беспокоить". Для отключения надо набрать код отключения этого режима (по умолчанию 559).

нет.
Данная ситуация воспроизводится так:
-звоните на внутренний телефон
-при сигнале вызова нажимаете Flash + 556
-положите трубку
В итоге сняв трубку абонента которому вы звонили вы услышите прерывистый сигнал, который означает наличие ожидающего вызова (Message Wait).
Снимается набором 557, при этом производится звонок на номер телефона с которого был произведен звонок на шаге 1 (руководство пп. 2.4.16).